1/适用范围:
适用于快速提取动物(含昆虫)microRNA或者microRNA/总RNA分别提取。
2/试剂盒组成、储存、稳定性:
试剂盒组成
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保存
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50次(RE146-01)
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裂解液LBT Plus
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室温
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50 ml
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PLA
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室温
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5 ml
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漂洗液A
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室温
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12 ml
第一次使用前加入28ml无水乙醇
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漂洗液B
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室温
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10 ml
第一次使用前加入42ml无水乙醇
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RNase-free H2O
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室温
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10 ml
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微量基因组DNA清除柱CC
和收集管CT
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室温
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50套
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RNase-free
吸附柱AC和收集管CT
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室温
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50套
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本试剂盒在室温储存6个月不影响使用效果。
3/储存事项:
1、所有的溶液应该是澄清的,如果环境温度低时溶液可能形成沉淀,此时不应该直接使用,可在37℃水浴加热几分钟,即可恢复澄清。
2、不合适的储存于低温(4℃或者-20℃)会造成溶液沉淀,影响使用效果,因此运输和储存均在室温下(15℃-25℃)进行。
3、漂洗液B可能加入乙醇使用几天后出现沉淀晶体,并不影响使用,直接不吸晶体,吸上清使用就可以。
4、避免试剂长时间暴露于空气中产生挥发、氧化、PH值变化,各溶液使用后应及时盖紧盖子。
4/产品介绍:
传统的microRNA提取试剂盒均是采用异硫氰酸胍/苯酚/氯仿(TRIzol法)加高浓度乙醇硅胶膜吸附小片段microRNA的原理方法制成,但是复杂的样品用TRIzol的原理甚至无法提取符合要求的总RNA,更不用说microRNA。因此很多世界著名公司采用Trizol法原理的microRNA提取试剂盒面临复杂样品时束手无策,产品线中干脆就没有复杂样品microRNA提取试剂盒。用户万般无奈只好用传统方法,或者TRIzol法提取,用异丙醇/乙醇沉淀方法来提取microRNA,虽然也能提取到部分microRNA,但是沉淀法损失巨大或者和杂质共沉淀,影响实验结果,投稿时常常面临质疑。而本试剂盒在创新性的不用苯酚、氯仿的技术路线下解决该问题。
独特的裂解液迅速裂解细胞和灭活细胞RNA酶,RNA助提剂PLA帮助结合多糖多酚并通过离心去除,然后裂解混合物通过基因组DNA清除柱CC,基因组DNA被清除而RNA(包括microRNA)被选择性滤过。滤过的RNA用乙醇调节结合条件后,RNA在高离序盐状态下选择性吸附于离心柱内硅基质膜,再通过一系列特殊漂洗液快速的漂洗-离心的步骤,将细胞代谢物,蛋白等杂质去除,最后低盐的RNase free H20将纯净RNA(包括microRNA)从硅基质膜上洗脱。
采用分提取操作步骤也可单独纯化富集后的microRNA组分和总RNA(>200 nt)从而得到分离富集的microRNA和RNA。
5/产品特点:
1、完全不使用有毒的苯酚,氯仿等试剂,也不需要乙醇沉淀等步骤。
2、快速,简捷,单个样品操作一般可在30分钟内完成。
3、独有的RNA助提剂可以有效提高清除效果。
4、多次柱漂洗确保高纯度,OD260/OD280典型的比值达2.0~2.2,可用于RT-PCR,Northern-blot和各种实验。
6/注意事项
1、所有的离心步骤均可在室温完成(或4℃离心也可以),使用转速可以达到13,000 rpm的传统台式离心机。
2、需要自备乙醇,β-巯基乙醇,研钵(可选)。
3、样品处理量绝对不要超过基因组清除柱CC和和RNA吸附柱AC处理能力,否则造成DNA残留或产量降低。开始摸索实验条件时,如果不清楚样品DNA/RNA含量时可使用较少的样品处理量,将来根据样品试验情况增加或者减少处理量。
4、裂解液LBT Plus和漂洗液A中含有刺激性化合物,操作时戴乳胶手套,避免沾染皮肤,眼睛和衣服。若沾染皮肤、眼睛时,要用大量清水或者生理盐水冲洗。
5、关于DNA 的微量残留:
一般说来任何总RNA提取试剂在提取过程中无法完全避免DNA的微量残留(DNase消化也无法做到100%无残留),该产品由于采取了本公司独特的缓冲体系和基因组DNA清除柱技术,绝大多数DNA已经被清除,个别特殊情况需要清除微量基因组DNA残留,可使用以下几种DNA酶消化的方式。
- ① 传统DNA酶消化提取的RNA/microRNA,热灭活DNA酶后直接用于后续实验。
- ② 传统DNA酶消化提取的RNA/microRNA,然后使用RNA清洁纯化试剂盒(货号:RE132,但是需要将说明书改动一个地方,第二步加入250μl无水乙醇改成加入700μl无水乙醇)清洁纯化后用于后续实验。
- ③ 直接在吸附柱AC上进行DNase I柱上消化处理。购买DNA酶柱上消化试剂盒(货号:RE128,但是需将说明书的去蛋白液PRS改成漂洗液A) 可先索取具体操作说明书。
6、碰到特别复杂多糖多酚,淀粉等次级代谢产物特别丰富的样品,如葡萄果实,水稻种子,裂解液LBT Plus效果不佳的情况下,应该购买专用裂解液CLB。裂解液CLB是本公司为特别复杂的样品研发的最强配方,绝大部分裂解液LBT Plus无法提取的复杂样品都可以提取成功。见附录3。
7/操作步骤:(实验前请先阅读注意事项)
提示:
● 第一次使用前请先在漂洗液A和漂洗液B瓶加入指定量无水乙醇!
● 对于RNA酶或者特殊组织:操作前在裂解液LBT Plus中加入β-巯基乙醇至终浓度1%,如1 ml LBT Plus 中加入10μl β-巯基乙醇。此裂解液最好现用现配。配好的LBT Plus 4℃可放置一个月。
1、直接研磨法(提取简单样品推荐此法,但是简单样品也可以用液氮研磨法):
a. 新鲜组织称重后取100mg迅速剪成小块放入研钵(冰冻保存或者液氮保存样品可直接称重后取100mg放入研钵), 加入10体积(1ml)LBT Plus和1体积(100μl) PLA 室温下充分研磨成匀浆,注意应该迅速研磨让组织和裂解液LBT Plus立刻充分接触以抑制RNA酶活性。
注:PLA是提取困难样品不可缺少成分。
b. 将裂解物转入离心管,剧烈摇晃振荡15秒,13,000rpm离心5-10分钟,沉淀不能裂解的碎片和结合有杂质的PLA。
c. 取480μl裂解物上清(在不超过基因组DNA清除柱CC能力的情况下可以取更多的上清,这样可以提高产量,如残留基因组DNA较多,可适当减少取上清量)将裂解物上清加到DNA清除柱CC上(清除柱CC放在收集管CT内)。
d. 立刻接操作步骤的步骤3。
2、液氮研磨法(提取复杂,易降解样品时推荐此法):
a. 取500μl裂解液LBT Plus,转入1.5ml离心管中,加50μl PLA混匀备用。
b. 液氮中研磨适量组织成细粉后,取50mg细粉转入上述装有LBT Plus和PLA的离心管, 立即用手剧烈振荡20秒,充分裂解。
c. 用吸头吹打混匀帮助裂解或者剧烈涡旋震荡直到得到满意匀浆结果(或者电动匀浆30秒),可以剪切DNA,降低粘稠度和提高产量。
d. 将裂解物13,000 rpm离心5-10分钟,沉淀不能裂解的碎片和结合有杂质的PLA。
e. 取裂解物上清(在不超过基因组DNA清除柱CC能力的情况下可以取更多的上清,这样可以提高产量)将裂解物上清加到DNA清除柱CC上(清除柱CC放在收集管CT内)。
f. 立刻接操作步骤的步骤3。
注意:以上液氮研磨法用户可以根据需要加倍处理,可以提高产量。也就是使用1ml的裂解液LBT Plus和100μl PLA和100mg的样品。
3、立即13,000 rpm离心60秒,收集滤液(RNA在滤液中)。
4、用微量移液器较精确估计滤过液体积(480μl左右,滤过时候损失体积应该减去),加入1.25倍体积的无水乙醇,此时可能出现沉淀,但是不影响提取过程,立即吹打混匀,不要离心。
5、立刻将混合物(每次小于700μl,多可以分两次加入)加入一个吸附柱AC中,(吸附柱AC放入收集管CT中)13,000 rpm离心30秒,弃掉废液。
确保离心后液体全部滤过去,膜上没有残留,如有必要,可以加大离心力和离心时间。
6、加700μl 漂洗液A(请先检查是否已加入无水乙醇!),12,000rpm 离心30秒,弃掉废液。
7、加入500μl 漂洗液B(请先检查是否已加入无水乙醇!),12,000 rpm 离心30秒,弃掉废液。加入500μl 漂洗液B,重复一遍。
8、将吸附柱AC放回空收集管CT中,13,000 rpm离心2分钟,尽量除去漂洗液, 以免漂洗液中残留乙醇抑制下游反应。
9、取出吸附柱AC,放入一个RNase free离心管中,根据预期RNA产量在吸附膜的中间部位加30-50μl RNase free water, 室温放置1分钟,12,000 rpm 离心1分钟。
将洗脱液加回到吸附柱重复洗脱步骤一遍可以提高产量约10-15%。
10、得到的RNA/microRNA可以立即用于下游反应或者尽快置于低温保存。
8/附录1:microRNA富集方法(microRNA/去除了microRNA的总RNA分别提取)
提示:
● 对于RNA酶或者特殊样品组织:操作前在裂解液LBT Plus中加入β-巯基乙醇至终浓度1%,如1 ml LBT Plus 中加入10μl β-巯基乙醇。此裂解液最好现用现配。配好的LBT Plus 4℃可放置一个月。
1、直接研磨法(提取简单样品推荐此法,但是简单样品也可以用液氮研磨法):
a. 新鲜组织称重后取100mg迅速剪成小块放入研钵(冰冻保存或者液氮保存样品可直接称重后取100mg放入研钵),加入10体积(1ml)LBT Plus和1体积(100μl) PLA 室温下充分研磨成匀浆,注意应该迅速研磨让组织和裂解液RLT立刻充分接触以抑制RNA酶活性。
注:PLA是提取困难样品不可缺少成分。
b. 将裂解物转入离心管,剧烈摇晃振荡15秒,13,000rpm离心5-10分钟,沉淀不能裂解的碎片和结合有多糖多酚的PLA。
c. 取480μl裂解物上清(在不超过基因组DNA清除柱CC能力的情况下可以取更多的上清,这样可以提高产量,如残留基因组DNA较多,可适当减少取上清量)转到一个新离心管。加入上清体积一半的无水乙醇(0.5体积),此时可能出现沉淀,但是不影响提取过程,立即吹打混匀,不要离心。
d. 立刻接富集方法的步骤3。
2、液氮研磨法(提取复杂,易降解样品时推荐此法):
a. 取500μl裂解液LBT Plus,转入1.5ml离心管中,加50μl PLA混匀备用。
b. 液氮中研磨适量组织成细粉后,取50mg细粉转入上述装有LBT Plus和PLA的离心管, 立即用手剧烈振荡20秒,充分裂解。
c. 用吸头吹打混匀帮助裂解或者剧烈涡旋震荡直到得到满意匀浆结果(或者电动匀浆30秒),可以剪切DNA,降低粘稠度和提高产量。
d. 将裂解物13,000 rpm离心5-10分钟,沉淀不能裂解的碎片和结合有杂质的PLA。
e. 取裂解物上清(在不超过基因组DNA清除柱CC能力的情况下可以取更多的上清,这样可以提高产量)转到一个新离心管。加入上清体积一半的无水乙醇(0.5体积),此时可能出现沉淀,但是不影响提取过程,立即吹打混匀,不要离心。
f. 立刻接富集方法的步骤3。
注意:以上液氮研磨法用户可以根据需要加倍处理,可以提高产量。也就是使用1ml的裂解液LBT Plus和100μl PLA和100mg的样品。
3、将混合物(每次小于720μl,多可以分两次加入)加入一个基因组清除柱CC中,(清除柱CC放入收集管CT中)13,000 rpm离心2分钟,保留滤液(microRNA在滤液中)。
此时,滤过液含有microRNA,基因组DNA清除柱CC上面是去除了microRNA的总RNA(不包含microRNA),如果需要,可以按照前面标准操作步骤6-10操作漂洗,洗脱回收得到去除了microRNA的总RNA。
4、用微量移液器较精确估计滤过液体积,加入0.65倍体积无水乙醇(必须是室温的),涡旋或者吹打充分混匀,不要离心。
5、立刻将混合物(每次小于700μl,多可以分两次加入)加入一个吸附柱AC中,(吸附柱放入收集管CT中)13,000 rpm离心2分钟,弃掉废液。
确保离心后液体全部滤过去,膜上没有残留,如必要,可加大离心力和离心时间。
6、按照前面标准操作步骤6-10操作漂洗,洗脱得到富集的microRNA。
注意:不同的实验可以选择不同的方法,例如Northern Blot或者表达芯片谱分析可以选择提取包括microRNA的总RNA。富集方法提取的microRNA因为去除了较大片段的mRNA和rRNA等,可能减少某些下游试验的扩增背景,当背景较高或者非特异扩增较多时,可以尝试使用富集方法提取的microRNA。
9/附录2:DNA酶柱上消化(详细请参考DNase I 柱上消化试剂盒说明书)
1、按照前面所列操作步骤操作,直到做完操作步骤5。
2、取45μl DNase I buffer和5μl RNase free DNase I在离心管轻轻吹打混匀成工作液(处理多个离心柱子要按照比例放大制备工作液)。
3、向吸附柱AC 中加入350μl 漂洗液A,12,000 rpm 离心30 秒,弃废液,将吸附柱放回收集管CT中。
4、向吸附柱AC 中央加入50μl的DNase I 工作液,室温(20℃-30℃)放置15分钟。注意直接将工作液滴在膜中央上向膜四周浸润充分和膜接触,不要让工作液滴在O型垫圈或是离心柱管壁上挂壁或者挂在垫圈上不能充分和膜接触。
5、向吸附柱AC 中加入350μl 漂洗液A,12,000 rpm 离心30-60 秒,弃废液,将吸附柱放回收集管CT中。
6、接操作步骤7完成后续步骤。
10/附录3:使用裂解液CLB
提示:
● 第一次使用前请先在漂洗液A和漂洗液B瓶加入指定量无水乙醇!
● 取1ml裂解液 CLB至离心管内(如果CLB有析出或者沉淀需先置于65°C水浴重新溶解), 在裂解液CLB中加入5%ß-巯基乙醇(1ml CLB加50μl ß-巯基乙醇)。颠倒混匀后65°C水浴中预热。
1、液氮中研磨新鲜或-70°C冷冻的材料至细粉。
2、转移100-150mg细粉(水分少的样品如种子叶片等可加100mg,水分多的样品如西瓜可多加一些)加至预热的裂解液CLB(已加有ß-巯基乙醇)离心管中,立即激烈涡旋30-60秒或者用吸头吹打混匀裂解,短时放回 65°C水浴中(5 min-10 min,时间稍长一点10分钟产量可能提高一些),中间偶尔颠倒1-2次帮助裂解。
ß-巯基乙醇是裂解液CLB的关键成分,必要的时候可以提高终浓度到10-20%。
3、振荡混匀后室温13,000rpm离心10分钟。
4、取裂解物上清(在不超过基因组DNA清除柱CC能力的情况下可以取更多的上清,这样可以提高产量)转到一个新离心管。
若上清表面有漂浮物,用吸头挑开吸取下面液体即可。
5、立刻接后续操作步骤。