1芯片生物信息学服务

对基因芯片的表达谱数据进行预处理与归一化分析,筛选显著差异表达的基因,对差异表达的基因数据进行聚类分析,进行规模化的染色体定位分析和基于染色体和转录因子的转录调控分析,并结合基因分类数据库和信号转导数据库进行基因的分类和注释、相关代谢路径和信号通路的分析。

2芯片生物信息学服务类型

Ø  差异表达基因分析和聚类分析
基因芯片数据标准化、上调基因/下调基因、t-检验(P值)、方差分析(F-检验)、基因聚类(Cluster)、热图(Heatmap)、多样本分子标志物聚类(如肿瘤分子标志物聚类分析)。可分析mRNA表达谱、miRNA表达谱和甲基化基因芯片数据表达谱差异。(结果形式:分析表格、红绿热图、Cluster分类树)

Ø  基因数据相关性分析
分析内容:基因芯片数据质量控制和分析(结果形式:相关性分析结果表格)。

Ø  GO差异基因功能富集分析(Gene Ontology
意义:可以告诉研究者差异基因所调控的生物学功能中哪些是最重要的, 哪些生物学过程需要深入研究,哪些酶的活性需要重点关注等。
分析内容:包含基因芯片内所有差异表达基因的GO功能注释(结果形式:注释表格)和GO功能富集分析图(结果形式:热图Heatmap/聚类Cluster/功能调控图)。

Ø  Pathway分析
意义:了解差异基因影响的主要信号通路调控机制和重点调控的蛋白。
分析内容:最重要的几个差异基因相关的KEGG代谢通路图、表示通路被调控程度的热图,(结果形式:pathway表格)、Pathway富集分析图(结果形式:热图Heatmap/聚类Cluster ,富集参数表格/KEGG代谢通路图,含研究基因的颜色标记)

Ø  甲基化位点分析
分析内容:甲基化位点分布,高甲基化/低甲基化位点分布(结果形式:饼图或柱图)

Ø  SNP位点分析
分析内容:分析某一细胞信号转导通路机制或某一疾病相关的主要SNP位点。(结果形式:分析表格)

3 服务流程

4 服务优势

技术保障:密码子公司拥有经验丰富的专家队伍,全程为您解决技术与服务疑问,定期更新项目信息、及时追踪您的项目进展。

便捷的在线订单系统:网络在线订购和数据检索服务,方便您下订单并查阅数据。提供测序数据存档,技术支持及在线留言功能。

5实验结果交付

序号

名称

交付形式

1

差异表达基因分析和聚类分析

分析表格、红绿热图、Cluster分类树

2

基因数据相关性分析

相关性分析结果表格

3

Gene Ontology

热图Heatmap/聚类Cluster/功能调控图

4

Pathway分析

热图Heatmap/聚类Cluster ,富集参数表格/KEGG代谢通路图,含研究基因的颜色标记

5

miRNA靶点基因预测

注释表格

6

甲基化位点分析

饼图或柱图

7

SNP位点分析

分析表格