GC-MS和LC-MS两种平台各有优势,主要是由目标化合物的理化性质决定,GC-MS适合易挥发性、分子量不太大的化合物,而且,离子源为EI,碎片信息多,有成熟的图谱库,便于化合物检索,对于非挥发性成分则需要衍生化;而LC-MS离子源为APCI或者ESI源,适合做中等或强极性的化合物,分子量范围广,灵敏度高,前处理简单,但是LC-MS的价格要贵点,因此可以根据实际情况选择合适的检测平台。